Hoewel het Allecto Bahtinov-masker veel voordelen heeft, zijn er ook enkele duidelijke beperkingen en aandachtspunten. Allereerst is de diameterrange van 63–89 mm beperkend: grote refractors, veel Schmidt-Cassegrain- of grotere Newton-voortuigen vallen buiten deze maat. Als je meerdere telescopen met uiteenlopende diameters bezit heb je mogelijk meerdere maskers nodig. Dat is zowel onpraktisch als kostentechnisch minder aantrekkelijk.
Een praktisch risico is het metalen klemmechanisme. De drie metalen kolommen klemmen stevig vast, wat zeker in koude omstandigheden en bij herhaald gebruik prettig is. Maar als je niet voorzichtig bent met aandraaien of als de binnenzijde van de klemmen geen beschermende laag heeft, kun je lichte krassen of afdrukken op de lak van je tubus veroorzaken. Bij gevoelige finish of carbonbuizen moet je daarom extra voorzichtig zijn of nadenken over het toevoegen van zachte tape tussen klem en buis.
Verder kan het masker, zoals alle Bahtinov-maskers, niet gebruikt worden op uitgebreide diffuse objecten of bij dagobservatie zonder heldere ster; het vereist een puntbron. Ook kan het masker in sommige setups licht vignetteren, vooral bij korte focal length systemen of wanneer een camera met grote sensor achter de focuser gebruikt wordt. Tot slot: het masker geeft scherpe visuele aanwijzingen, maar verfijnde microfijninstellingen blijven afhankelijk van je focuser en eventuele elektronische focussing voor de laatste paar micrometer—het masker is geen vervanging voor een kwalitatieve focuser maar een aanvullend hulpmiddel.